基于机器学习的基因组微卫星状态探测方法综述

张舒莹,韩鑫胤,何小雨,袁丹阳,栾海晶,李瑞琳,何佳茵,牛北方

Review of Genomic Microsatellite Status Detection Based on Machine Learning

ZHANG Shuying,HAN Xinyin,HE Xiaoyu,YUAN Danyang,LUAN Haijing,LI Ruilin,HE Jiayin,NIU Beifang

表1 基于机器学习的MSI检测方法

Table 1 MSI detection methods based on machine learning

方法 测序方法 机器学习算法 准确率（%） 灵敏性（%） 特异性（%） MSIseq[38] WES 决策树 98.8 - - MSIpred[39] WES 支持向量机 98.3 93.6 99.6 MOSAIC[40] WES 决策树 96.6 95.8 97.6 MIRMMR[41] - 逻辑回归 93.8 91.9 94.2 MIAmS[42] TS（amplicon panel） 支持向量机（默认） 100.0 - -